প্রশাসন ও অর্থ শাখা যাবতীয় প্রশাসনিক ও আর্থিক বিষয়াদি নিয়ে কাজ করে থাকে। হিসাব রক্ষণ অফিসের সাথে আর্থিক বিষয় সংক্রান্ত ক্ষেত্রে এই শাখা গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে থাকে। বিএনসিইউ’র বিবিধ প্রশাসনিক কর্মকান্ডের অংশ হিসেবে সভা, সমিনার, প্রশিক্ষণ, জাতীয় এবং আন্তর্জাতিক পর্যায়ের ওয়েবিনার আয়োজন সংশ্লিষ্ট দায়িত্ব পালন করে থাকে।শিক্ষা মন্ত্রণালয়ের সাথে সকল ধরণের যোগাযোগ রক্ষা করে থাকে। কর্মকর্তা/কর্মচারীদের ছুটি অথবা পেনশন সংক্রান্ত দায়িত্ব পালন করে থাকে।